菌體分離機針對生物制品要求低溫生產的特點，可以設冷卻裝置，以滿足工藝要求。在菌體分離工藝中，為保證菌體活性可采用逆止閥及轉鼓襯里裝置，以防止物料染菌。

　　菌體分離機是管式分離機系列中的一種，該機分離菌體主要有嗜酸乳桿菌、干酪乳桿菌、詹氏乳桿菌、拉曼乳桿菌、長雙歧桿菌、短雙歧桿菌、卵形雙歧桿菌、嗜熱雙歧桿菌、糞鏈球菌、乳球菌、中介鏈球菌、保加利亞桿菌、酵母菌及破壁酵母等。該機保證了普通發酵和高密度發酵后菌體以及菌體衍生物*分離，提高收益率，增加產量。